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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
06/06/2023 |
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Data da última atualização: |
06/06/2023 |
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Autoria: |
SILVA, L. L. DA. |
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Afiliação: |
LEANDRO LOPES DA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO RECÔNCAVO DA BAHIA. |
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Título: |
Ferramentas moleculares para a caracterização de Colletotrichum spp. associados à antracnose da mandioca. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agrícola) - Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Cruz das Almas, 2016. 94 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Orientador - Dr. Saulo Alves Santos de Oliveira Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF).
Dr. Thiago Alves Santos de Oliveira,Universidade Federal do Recôncavo da Bahia.
Dr. Aristóteles Pires de Matos, Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF). |
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Conteúdo: |
RESUMO A antracnose causada pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides sensu lato é uma importante doença em diversas culturas, dentre elas a mandioca. Devido a dificuldade de identificação do patógeno por meio de características morfológicas, métodos moleculares vêm sendo utilizados no auxílio de diferenciação e identificação do patógeno. O presente estudo teve por objetivo testar métodos moleculares na diferenciação de linhagens filogenéticas de C. gloeosporioides sensu lato que possam ser utilizados para o direcionamento do sequenciamento. Desta forma, materiais vegetais que apresentavam sintomas da doença foram coletados em 17 cidades pertencentes ao Recôncavo da Bahia para a realização do isolamento e obtenção de culturas monospóricas do patógeno. Folhas sadias de mandioca foram utilizadas para a inoculação do patógeno e teste de patogenicidade.Duas estratégias foram utilizadas, sendo a primeira o agrupamento dos isolados por meio de regiões repetitivas BOX e ERIC; e segunda técnicas baseadas em PCRRFLP realizadas in silico e in gel. Para a análise das regiões repetitivas, os produtos de PCR foram corridos em gel de agarose 1,5%, seguido de análise das bandas apresentadas. Para a análise dos dados, os padrões de bandas apresentados nos géis foram convertidos em matrizes sendo ?0? ausência da banda e ?1? presença. As matrizes binárias obtidas foram utilizadas para estimativa de distância genética e construção de dendrogramas. Enquanto que para a técnica de PCR-RFLP, análises in silico foram realizadas para a determinação das regiões gênicas de maior potencial de separação das linhagens filogenéticas do complexo, bem como as melhores combinações de enzimas de restrição a serem utilizadas. Após a escolha da região, foram realizados ensaios in gel (amplificação por PCR e digestão com enzimas de restrição). Os produtos da clivagem foram observados em gel de agarose 2%. Para as regiões repetitivas, o BOX-PCR apresentou um baixo polimorfismo para os isolados testados, enquanto que a amplificação baseada em ERIC-PRC apresentou um maior grau de polimorfismo, e permitiu um melhor agrupamento de indivíduos e separação de algumas linhagens filogenéticas dentro do complexo C. gloeosporioides. O uso conjunto de dados do BOX e ERIC-PCR diminuiu a capacidade discriminatória apresentada somente por ERIC. Em relação à técnica de PCR-RFLP, a combinação (região de interesse + enzima de restrição) que apresentou maior potencial discriminatório das linhagens filogenéticas foi a Calmodulina (CAL), nas análises in silico. Sendo que as enzimas que apresentaram melhor resultado foram AluI, BsuRI, HhaI, HinfI, MspI e TaqI. A validação destas análises in gel permitiu observar os mesmo padrões esperados das análises in silico, inclusive, possibilitanto a utilização de dados ?híbridos?, ou seja, estimativa da provável linhagen filogenética dos indivíduos com base no padrão esperado para cada uma das espécies do complexo C. gloeosporioides gerados nas análises in silico, comparando-os com os padrões de banda obtidos nas análises in gel. A utilização de ERIC-PCR e CAL PCR-RFLP na diferenciação de linhagens filogenéticas pertencentes ao complexo C. gloeosporioides mostrou-se eficiente na diferenciação de espécimes, podendo ser utilizada como ferramentas de auxílio na identificação e direcionamento do sequenciamento. MenosRESUMO A antracnose causada pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides sensu lato é uma importante doença em diversas culturas, dentre elas a mandioca. Devido a dificuldade de identificação do patógeno por meio de características morfológicas, métodos moleculares vêm sendo utilizados no auxílio de diferenciação e identificação do patógeno. O presente estudo teve por objetivo testar métodos moleculares na diferenciação de linhagens filogenéticas de C. gloeosporioides sensu lato que possam ser utilizados para o direcionamento do sequenciamento. Desta forma, materiais vegetais que apresentavam sintomas da doença foram coletados em 17 cidades pertencentes ao Recôncavo da Bahia para a realização do isolamento e obtenção de culturas monospóricas do patógeno. Folhas sadias de mandioca foram utilizadas para a inoculação do patógeno e teste de patogenicidade.Duas estratégias foram utilizadas, sendo a primeira o agrupamento dos isolados por meio de regiões repetitivas BOX e ERIC; e segunda técnicas baseadas em PCRRFLP realizadas in silico e in gel. Para a análise das regiões repetitivas, os produtos de PCR foram corridos em gel de agarose 1,5%, seguido de análise das bandas apresentadas. Para a análise dos dados, os padrões de bandas apresentados nos géis foram convertidos em matrizes sendo ?0? ausência da banda e ?1? presença. As matrizes binárias obtidas foram utilizadas para estimativa de distância genética e construção de dendrogramas. Enquanto que para a técnica de PCR-RFLP, análi... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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260 $aDissertação (Mestrado em Microbiologia Agrícola) - Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Cruz das Almas, 2016. 94 f.$c2016
500 $aOrientador - Dr. Saulo Alves Santos de Oliveira Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF). Dr. Thiago Alves Santos de Oliveira,Universidade Federal do Recôncavo da Bahia. Dr. Aristóteles Pires de Matos, Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF).
520 $aRESUMO A antracnose causada pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides sensu lato é uma importante doença em diversas culturas, dentre elas a mandioca. Devido a dificuldade de identificação do patógeno por meio de características morfológicas, métodos moleculares vêm sendo utilizados no auxílio de diferenciação e identificação do patógeno. O presente estudo teve por objetivo testar métodos moleculares na diferenciação de linhagens filogenéticas de C. gloeosporioides sensu lato que possam ser utilizados para o direcionamento do sequenciamento. Desta forma, materiais vegetais que apresentavam sintomas da doença foram coletados em 17 cidades pertencentes ao Recôncavo da Bahia para a realização do isolamento e obtenção de culturas monospóricas do patógeno. Folhas sadias de mandioca foram utilizadas para a inoculação do patógeno e teste de patogenicidade.Duas estratégias foram utilizadas, sendo a primeira o agrupamento dos isolados por meio de regiões repetitivas BOX e ERIC; e segunda técnicas baseadas em PCRRFLP realizadas in silico e in gel. Para a análise das regiões repetitivas, os produtos de PCR foram corridos em gel de agarose 1,5%, seguido de análise das bandas apresentadas. Para a análise dos dados, os padrões de bandas apresentados nos géis foram convertidos em matrizes sendo ?0? ausência da banda e ?1? presença. As matrizes binárias obtidas foram utilizadas para estimativa de distância genética e construção de dendrogramas. Enquanto que para a técnica de PCR-RFLP, análises in silico foram realizadas para a determinação das regiões gênicas de maior potencial de separação das linhagens filogenéticas do complexo, bem como as melhores combinações de enzimas de restrição a serem utilizadas. Após a escolha da região, foram realizados ensaios in gel (amplificação por PCR e digestão com enzimas de restrição). Os produtos da clivagem foram observados em gel de agarose 2%. Para as regiões repetitivas, o BOX-PCR apresentou um baixo polimorfismo para os isolados testados, enquanto que a amplificação baseada em ERIC-PRC apresentou um maior grau de polimorfismo, e permitiu um melhor agrupamento de indivíduos e separação de algumas linhagens filogenéticas dentro do complexo C. gloeosporioides. O uso conjunto de dados do BOX e ERIC-PCR diminuiu a capacidade discriminatória apresentada somente por ERIC. Em relação à técnica de PCR-RFLP, a combinação (região de interesse + enzima de restrição) que apresentou maior potencial discriminatório das linhagens filogenéticas foi a Calmodulina (CAL), nas análises in silico. Sendo que as enzimas que apresentaram melhor resultado foram AluI, BsuRI, HhaI, HinfI, MspI e TaqI. A validação destas análises in gel permitiu observar os mesmo padrões esperados das análises in silico, inclusive, possibilitanto a utilização de dados ?híbridos?, ou seja, estimativa da provável linhagen filogenética dos indivíduos com base no padrão esperado para cada uma das espécies do complexo C. gloeosporioides gerados nas análises in silico, comparando-os com os padrões de banda obtidos nas análises in gel. A utilização de ERIC-PCR e CAL PCR-RFLP na diferenciação de linhagens filogenéticas pertencentes ao complexo C. gloeosporioides mostrou-se eficiente na diferenciação de espécimes, podendo ser utilizada como ferramentas de auxílio na identificação e direcionamento do sequenciamento.
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650 $aMandioca
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
09/11/2006 |
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Data da última atualização: |
13/06/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
VICENTE, W.; BERGAMASCHI, M. A. C. M.; VICENTE, W. R. R.; BARBOSA, R. T.; MACHADO, R.; BARUSELLI, P. S.; ALENCAR, M. M. de; BINELLI, M. |
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Afiliação: |
MARCO AURELIO C MEIRA BERGAMASCHI, CPPSE; ROGERIO TAVEIRA BARBOSA, CPPSE/SÃO CARLOS, SP.; RUI MACHADO, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE. |
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Título: |
Effects of equine chrionic gonadotrophin (eCG) on corpus luteum development and progesterone concentrations in Nelore cows. |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORLD BUIATRICS CONGRESS, 24., 2006, Nice, France. Proceedings... Nice: Société Française de Buiatrie French Buiatrics Association, 2006. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
This trial aimed to test eCG as an enhancer of the luteal function, as well as to evaluate the ability of eCG to delay or prevent luteolysis mechanism. A group of 32 mature, synchronized (CRESTAR@), lactating Nelore (Bos taurus indicus) cows were randomly allotted to receive either 400 lU of eCG at implant withdrawal (GeCG; n=16) or remain as contrais (GC; n=16). Ultrasound per rectum evaluation of avaries was conducted daily, from implant rem oval up to the following ovulation (a complete estrous cycle). Simultaneously, blood samples were taken to determine plasmatic concentration of progesterone ([P4]). Data were analyzed by GLM of the SAS program. GeCG showed non-significant (P>.05) higher volume of corpus luteum (CL) from day 3 after synchronized ovulation up to lhe rest of lhe luteal phase. In addition, eCG promoted a longer lasting growing period of lhe CL without changing its growing rale (P>.05) as compared to GC. As a result, CI maximum volume was reached later (9.2:t .47 days) and achieved a larger dimension (6927.5:t 405.86 mm3) for GeCG than occurred for GC (respectively, 7.7:t .47 days and 5437.8:t 405.86 mm3). The peak of [P4] was observed at lhe same time for both groups (11.3 t .59 and 11.4 t .59 days for GeCG and GC, respectively). However, maximum [P4] was higher (P<.O5) for GeCG (8.2 t .64 ng/mL) than Gc (6.4 t .64 ng/mL). Luteolysis also took place at lhe same time (P>.O5) for both groups (17.3 t .45 to GeCG and 17.1 t .45 days of lhe estrous cycle to GC). As a consequence, estrous cycle length did not differ (P>.O5) between treated (21.8 t .57 days) and non-treated cows (21.4 t .57 days). In summary, eCG not only increased CL dimension but also optimized [P4] over the luteal phase ofthe estrous cycle. Therefore, eCG given at implant removal provided a luteotrophic effect, but it was not capable to delay luteolysis. MenosThis trial aimed to test eCG as an enhancer of the luteal function, as well as to evaluate the ability of eCG to delay or prevent luteolysis mechanism. A group of 32 mature, synchronized (CRESTAR@), lactating Nelore (Bos taurus indicus) cows were randomly allotted to receive either 400 lU of eCG at implant withdrawal (GeCG; n=16) or remain as contrais (GC; n=16). Ultrasound per rectum evaluation of avaries was conducted daily, from implant rem oval up to the following ovulation (a complete estrous cycle). Simultaneously, blood samples were taken to determine plasmatic concentration of progesterone ([P4]). Data were analyzed by GLM of the SAS program. GeCG showed non-significant (P>.05) higher volume of corpus luteum (CL) from day 3 after synchronized ovulation up to lhe rest of lhe luteal phase. In addition, eCG promoted a longer lasting growing period of lhe CL without changing its growing rale (P>.05) as compared to GC. As a result, CI maximum volume was reached later (9.2:t .47 days) and achieved a larger dimension (6927.5:t 405.86 mm3) for GeCG than occurred for GC (respectively, 7.7:t .47 days and 5437.8:t 405.86 mm3). The peak of [P4] was observed at lhe same time for both groups (11.3 t .59 and 11.4 t .59 days for GeCG and GC, respectively). However, maximum [P4] was higher (P<.O5) for GeCG (8.2 t .64 ng/mL) than Gc (6.4 t .64 ng/mL). Luteolysis also took place at lhe same time (P>.O5) for both groups (17.3 t .45 to GeCG and 17.1 t .45 days of lhe estrous cycle to GC)... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Chrionic gonadotrophin; Nelore cows; progesterone concentrations. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/39032/1/PROCIMACMB2006.00097.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: WORLD BUIATRICS CONGRESS, 24., 2006, Nice, France. Proceedings... Nice: Société Française de Buiatrie French Buiatrics Association$c2006
520 $aThis trial aimed to test eCG as an enhancer of the luteal function, as well as to evaluate the ability of eCG to delay or prevent luteolysis mechanism. A group of 32 mature, synchronized (CRESTAR@), lactating Nelore (Bos taurus indicus) cows were randomly allotted to receive either 400 lU of eCG at implant withdrawal (GeCG; n=16) or remain as contrais (GC; n=16). Ultrasound per rectum evaluation of avaries was conducted daily, from implant rem oval up to the following ovulation (a complete estrous cycle). Simultaneously, blood samples were taken to determine plasmatic concentration of progesterone ([P4]). Data were analyzed by GLM of the SAS program. GeCG showed non-significant (P>.05) higher volume of corpus luteum (CL) from day 3 after synchronized ovulation up to lhe rest of lhe luteal phase. In addition, eCG promoted a longer lasting growing period of lhe CL without changing its growing rale (P>.05) as compared to GC. As a result, CI maximum volume was reached later (9.2:t .47 days) and achieved a larger dimension (6927.5:t 405.86 mm3) for GeCG than occurred for GC (respectively, 7.7:t .47 days and 5437.8:t 405.86 mm3). The peak of [P4] was observed at lhe same time for both groups (11.3 t .59 and 11.4 t .59 days for GeCG and GC, respectively). However, maximum [P4] was higher (P<.O5) for GeCG (8.2 t .64 ng/mL) than Gc (6.4 t .64 ng/mL). Luteolysis also took place at lhe same time (P>.O5) for both groups (17.3 t .45 to GeCG and 17.1 t .45 days of lhe estrous cycle to GC). As a consequence, estrous cycle length did not differ (P>.O5) between treated (21.8 t .57 days) and non-treated cows (21.4 t .57 days). In summary, eCG not only increased CL dimension but also optimized [P4] over the luteal phase ofthe estrous cycle. Therefore, eCG given at implant removal provided a luteotrophic effect, but it was not capable to delay luteolysis.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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